Ngày 9 tháng 5 năm 1981, UBND tỉnh Hà Tuyên ban hành Quyết định 213/QĐ-UB[1] về việc thành lập phường Trần Phú trên cơ sở địa bàn hai tiểu khu hành chính Yên Biên và Minh Khai.

Ngày 29 tháng 8 năm 1994, Chính phủ ban hành Nghị định số 112-CP[4] về việc thành lập phường Minh Khai trên cơ sở điều chỉnh 460 ha với dân số 5.431 người của phường Trần Phú.

Ngày 9 tháng 8 năm 2005, Chính phủ ban hành Nghị định 104/2005/NĐ-CP[5] về việc thành lập phường Ngọc Hà trên cơ sở điều chỉnh 117,20 ha diện tích tự nhiên và 628 người của phường Trần Phú.

Sau khi điều chỉnh, phường Trần Phú còn lại 244,80 ha diện tích tự nhiên và 6.462 nhân khẩu.

Ngày 27 tháng 9 năm 2010, Chính phủ ban hành Nghị quyết 35/NQ-CP[6] về việc thành lập thành phố Hà Giang thuộc tỉnh Hà Giang. Phường Trần Phú trực thuộc thành phố Hà Giang.